依据最新《靶向二代测序在感染性疾病诊疗中的规范化应用专家共识2025》^[1]（下文简称《共识》）推荐意见，结合广大医师的实际诊疗需求期望，美康盛德医检所近期完成对tNGS 项目的迭代优化，本年度升级新增如下主要内容：流感病毒分型鉴定、结核分枝杆菌耐药性位点的鉴定、妇幼感染常见病原，并探索性增加了高毒力肺克毒力基因，同时调整了报告结构和临床易读性。

升级亮点一：耐多药结核分枝杆菌（mTB）鉴定一步到位

图注：结核分枝杆菌耐药性演变的生物学机制^[2]

结核感染是临床与实验室诊断的重点和难点，结核耐药异质性及变迁问题日益严重。mNGS由于检测原理易受菌载量、片断随机性、高宿主细胞背景的影响，还不能稳健地检出耐药性基因位点；满足结核耐药性分析用途的分子项目位点数有限或者单独成项，这不仅牺牲了诊断效率，存在试错成本，反复送检还可能过度消耗BALF等宝贵的临床样本，为实现对结核病原学诊断及耐药性检测的一站式解决，本次升级新增了利福平和异烟肼的基石型抗结核治疗药物的基因耐药位点（rpoB、katG及inhA启动子区）。

tNGS结果示例

1.物种检出结果

2.微生物耐药基因及相关突变检测结果

PCR比对结果示例

升级亮点二:流感病毒的基因分型

▲图注：2014-2018年流感病毒阳性检出率周分布图（a：全国分布；b：中国北方分布；c：中国南方分布）^[3]

H1N1、H3N2是最常见的季节性流感，此外，还增加了乙型流感维多利亚（Victoria）、山形（Yamagata ）株系。流感的分子分型有助于从临床第一时间发现流感病毒的消长动态，提升公卫预防和治疗的针对性，降低院内流感共感染风险与重症发生率。

升级亮点三：预警高危——高毒力肺炎克雷伯菌（hvKP）毒力基因鉴定

▲图注：经典与高毒力肺炎克雷伯菌（Kp）菌株的四种明确毒力因子^[4]

hvKP 是肺炎克雷伯菌的高毒力变种，与经典肺克（cKP）相比具备更高的侵袭性和高致病力，常引起引发内脏的脓肿等侵袭性感染。通过联合检测iroB、peg-344、iucA、rmpA与 rmpA2五个核心毒力基因，可将hvKP与cKP准确区分，它为临床医生提供了关键决策支持，助力其提前预警重症、优化个体化治疗方案、准确判断预后，最终为患者赢得更佳的治愈机会。

1.物种检出结果

2.毒力因子编码基因检出结果

升级亮点四：拓展对围产期感染、新生儿脓毒症相关病原的覆盖范围，提升产科儿科临床适用性

▲图注：新生儿败血症的侵袭性细菌感染^[5]

tNGS 108项补充了微小脲支原体、解脲脲原体、沙眼衣原体、阴道毛滴虫、多瘤病毒 、肠道病毒、人类乙型疱疹病毒等妇儿感染常见病原体，为妇儿病原学诊断提供更全面的视角。

本次tNGS的全面升级，是我们致力于以技术创新驱动临床价值的又一力证。我们相信，每一次技术的革新，都是为了更精准地守护每一位患者的生命健康。

病原微生物靶向(targeted NGS,tNGS)检测

参考文献:

[1]Yin Y, Zhu P, Guo Y, et al.Enhancing lower respiratory tract infection diagnosis: implementation and clinical assessment of multiplex PCR-based and hybrid capture-based targeted next-generation sequencing. EBioMedicine. 2024 Sep;107:105307.

[2]Richard M, Jones Kristin N, Adams, Hassan E,et al.The evolving biology of Mycobacterium tuberculosis drug resistance.Frontiers.2022 Oct.

[3]Zhu AQ, Li ZJ, Zhang HJ. Spatial timing of circulating seasonal influenza A and B viruses in China from 2014 to 2018. Sci Rep. 2023 May 2;13(1):7149. 

[4]Paczosa MK, Mecsas J. Klebsiella pneumoniae: Going on the Offense with a Strong Defense. Microbiol Mol Biol Rev. 2016 Jun 15;80(3):629-61.

[5]Baharin NS, Duan M, Loe MWC, et al.Burden of antibiotic resistance in infections among very-low-birthweight infants in Singapore. Ann Acad Med Singap. 2023 Nov 29;52(11):561-569. 

[6]中国医学装备协会检验医学分会.靶向二代测序在感染性疾病诊疗中的规范化应用专家共识2025[J].中华检验医学杂志,2025,第48卷(4): 469-477.

[7]中国老年医学学会检验医学分会，上海市医学会检验医学专科分会，上海市微生物学会临床微生物学专业委员会.高毒力肺炎克雷伯菌实验室检测专家共识[J].中华检验医学杂志,2023,第46卷(11): 1164-1172.

[8]张岱，刘朝晖，洪锴，等.生殖道支原体感染诊治中国专家共识（2025年版）[J].中国实用妇科与产科杂志,2025,第41卷(5): 541-547.